Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd1cQ69ZK6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms