Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z98

Brsk2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, mousemouse

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk2Q69Z98 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brsk2Q69Z98 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brsk2Q69Z98 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brsk2Q69Z98 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brsk2Q69Z98 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brsk2Q69Z98 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brsk2Q69Z98 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brsk2Q69Z98 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brsk2Q69Z98 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brsk2Q69Z98 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Brsk2Q69Z98 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brsk2Q69Z98 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brsk2Q69Z98 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brsk2Q69Z98 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brsk2Q69Z98 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brsk2Q69Z98 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brsk2Q69Z98 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brsk2Q69Z98 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brsk2Q69Z98 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brsk2Q69Z98 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brsk2Q69Z98 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brsk2Q69Z98 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brsk2Q69Z98 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Brsk2Q69Z98 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brsk2Q69Z98 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms