Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab3ipQ68EF0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rab3ipQ68EF0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms