Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sbno1Q689Z5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sbno1Q689Z5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sbno1Q689Z5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms