Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY9

BC080695, cDNA sequence BC080695, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC080695Q66JY9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC080695Q66JY9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC080695Q66JY9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC080695Q66JY9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC080695Q66JY9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC080695Q66JY9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BC080695Q66JY9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC080695Q66JY9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC080695Q66JY9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC080695Q66JY9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC080695Q66JY9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC080695Q66JY9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC080695Q66JY9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BC080695Q66JY9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC080695Q66JY9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC080695Q66JY9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BC080695Q66JY9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BC080695Q66JY9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BC080695Q66JY9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BC080695Q66JY9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BC080695Q66JY9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BC080695Q66JY9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms