Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VclQ64727 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VclQ64727 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VclQ64727 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VclQ64727 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VclQ64727 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VclQ64727 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VclQ64727 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VclQ64727 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VclQ64727 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VclQ64727 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VclQ64727 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VclQ64727 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VclQ64727 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VclQ64727 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VclQ64727 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VclQ64727 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VclQ64727 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VclQ64727 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VclQ64727 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VclQ64727 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VclQ64727 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VclQ64727 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VclQ64727 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VclQ64727 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VclQ64727 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VclQ64727 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VclQ64727 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VclQ64727 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VclQ64727 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VclQ64727 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VclQ64727 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VclQ64727 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VclQ64727 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VclQ64727 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VclQ64727 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VclQ64727 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VclQ64727 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VclQ64727 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VclQ64727 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VclQ64727 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VclQ64727 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VclQ64727 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VclQ64727 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VclQ64727 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VclQ64727 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VclQ64727 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VclQ64727 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VclQ64727 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VclQ64727 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VclQ64727 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VclQ64727 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VclQ64727 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VclQ64727 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VclQ64727 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VclQ64727 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VclQ64727 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VclQ64727 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VclQ64727 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VclQ64727 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VclQ64727 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VclQ64727 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VclQ64727 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VclQ64727 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VclQ64727 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VclQ64727 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VclQ64727 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VclQ64727 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VclQ64727 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VclQ64727 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VclQ64727 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VclQ64727 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VclQ64727 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VclQ64727 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VclQ64727 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VclQ64727 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VclQ64727 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VclQ64727 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VclQ64727 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VclQ64727 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VclQ64727 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VclQ64727 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VclQ64727 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VclQ64727 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VclQ64727 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VclQ64727 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VclQ64727 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VclQ64727 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VclQ64727 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VclQ64727 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VclQ64727 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VclQ64727 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VclQ64727 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VclQ64727 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VclQ64727 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VclQ64727 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VclQ64727 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VclQ64727 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VclQ64727 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VclQ64727 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms