Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
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Sdc3Q64519 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Sdc3Q64519 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Sdc3Q64519 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc3Q64519 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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