Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Top2bQ64511 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Top2bQ64511 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms