Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Surf4Q64310 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms