Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Krt12Q64291 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt12Q64291 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt12Q64291 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt12Q64291 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt12Q64291 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Krt12Q64291 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms