Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Irf4Q64287 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Irf4Q64287 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms