Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

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Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa17Q64016 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms