Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PatjQ63ZW7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms