Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ift52Q62559 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ift52Q62559 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms