Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga3Q62470 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms