Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20854Q62461 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20854Q62461 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20854Q62461 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20854Q62461 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm20854Q62461 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Gm20854Q62461 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20854Q62461 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20854Q62461 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Gm20854Q62461 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Gm20854Q62461 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20854Q62461 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20854Q62461 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Gm20854Q62461 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Gm20854Q62461 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20854Q62461 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20854Q62461 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20854Q62461 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Gm20854Q62461 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Gm20854Q62461 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Gm20854Q62461 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Gm20854Q62461 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Gm20854Q62461 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20854Q62461 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20854Q62461 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20854Q62461 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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Gm20854Q62461 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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Gm20854Q62461 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Gm20854Q62461 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Gm20854Q62461 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Gm20854Q62461 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Gm20854Q62461 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20854Q62461 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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