Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Vamp1Q62442 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Vamp1Q62442 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Vamp1Q62442 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vamp1Q62442 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Vamp1Q62442 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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