Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxa13Q62424 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa13Q62424 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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