Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtmQ62388 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtmQ62388 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AtmQ62388 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AtmQ62388 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AtmQ62388 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AtmQ62388 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AtmQ62388 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtmQ62388 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtmQ62388 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AtmQ62388 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms