Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Supt6hQ62383 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Supt6hQ62383 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms