Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SypQ62277 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SypQ62277 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SypQ62277 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SypQ62277 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SypQ62277 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SypQ62277 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SypQ62277 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SypQ62277 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SypQ62277 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SypQ62277 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SypQ62277 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SypQ62277 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SypQ62277 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SypQ62277 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SypQ62277 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SypQ62277 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SypQ62277 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SypQ62277 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SypQ62277 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SypQ62277 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SypQ62277 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SypQ62277 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SypQ62277 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SypQ62277 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SypQ62277 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SypQ62277 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SypQ62277 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SypQ62277 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SypQ62277 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SypQ62277 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SypQ62277 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SypQ62277 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SypQ62277 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SypQ62277 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SypQ62277 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SypQ62277 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SypQ62277 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SypQ62277 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SypQ62277 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SypQ62277 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SypQ62277 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SypQ62277 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SypQ62277 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SypQ62277 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SypQ62277 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SypQ62277 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SypQ62277 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SypQ62277 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SypQ62277 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SypQ62277 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SypQ62277 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SypQ62277 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SypQ62277 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SypQ62277 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SypQ62277 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SypQ62277 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SypQ62277 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SypQ62277 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SypQ62277 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SypQ62277 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SypQ62277 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SypQ62277 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SypQ62277 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SypQ62277 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SypQ62277 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SypQ62277 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SypQ62277 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SypQ62277 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SypQ62277 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SypQ62277 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SypQ62277 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SypQ62277 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SypQ62277 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SypQ62277 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SypQ62277 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SypQ62277 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SypQ62277 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SypQ62277 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SypQ62277 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SypQ62277 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SypQ62277 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SypQ62277 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SypQ62277 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SypQ62277 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SypQ62277 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SypQ62277 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SypQ62277 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SypQ62277 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SypQ62277 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SypQ62277 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SypQ62277 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SypQ62277 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SypQ62277 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SypQ62277 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SypQ62277 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SypQ62277 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SypQ62277 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SypQ62277 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SypQ62277 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms