Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sprr1bQ62267 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms