Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sema3bQ62177 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sema3bQ62177 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms