Protein–RNA interactions for Protein: Q62170

Selplg, P-selectin glycoprotein ligand 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelplgQ62170 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SelplgQ62170 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SelplgQ62170 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SelplgQ62170 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SelplgQ62170 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SelplgQ62170 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SelplgQ62170 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SelplgQ62170 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SelplgQ62170 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SelplgQ62170 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SelplgQ62170 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SelplgQ62170 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SelplgQ62170 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SelplgQ62170 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SelplgQ62170 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SelplgQ62170 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SelplgQ62170 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SelplgQ62170 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SelplgQ62170 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SelplgQ62170 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SelplgQ62170 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SelplgQ62170 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SelplgQ62170 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SelplgQ62170 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SelplgQ62170 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SelplgQ62170 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SelplgQ62170 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SelplgQ62170 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SelplgQ62170 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SelplgQ62170 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SelplgQ62170 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SelplgQ62170 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SelplgQ62170 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SelplgQ62170 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms