Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sin3bQ62141 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sin3bQ62141 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms