Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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PtprrQ62132 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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PtprrQ62132 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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PtprrQ62132 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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PtprrQ62132 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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PtprrQ62132 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprrQ62132 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprrQ62132 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PtprrQ62132 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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PtprrQ62132 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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PtprrQ62132 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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