Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Odf1Q61999 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Odf1Q61999 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
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Odf1Q61999 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Odf1Q61999 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Odf1Q61999 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Odf1Q61999 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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