Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Npm1Q61937 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Npm1Q61937 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Npm1Q61937 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Npm1Q61937 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Npm1Q61937 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Npm1Q61937 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Npm1Q61937 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Npm1Q61937 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Npm1Q61937 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Npm1Q61937 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Npm1Q61937 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Npm1Q61937 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Npm1Q61937 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Npm1Q61937 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Npm1Q61937 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Npm1Q61937 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Npm1Q61937 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Npm1Q61937 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Npm1Q61937 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Npm1Q61937 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Npm1Q61937 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Npm1Q61937 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Npm1Q61937 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Npm1Q61937 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Npm1Q61937 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Npm1Q61937 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Npm1Q61937 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Npm1Q61937 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Npm1Q61937 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Npm1Q61937 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Npm1Q61937 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Npm1Q61937 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms