Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd47Q61735 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd47Q61735 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd47Q61735 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd47Q61735 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd47Q61735 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd47Q61735 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd47Q61735 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd47Q61735 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd47Q61735 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd47Q61735 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd47Q61735 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd47Q61735 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd47Q61735 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd47Q61735 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd47Q61735 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd47Q61735 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms