Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AtrxQ61687 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AtrxQ61687 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms