Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gli3Q61602 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gli3Q61602 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gli3Q61602 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms