Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pde3bQ61409 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pde3bQ61409 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pde3bQ61409 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pde3bQ61409 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pde3bQ61409 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pde3bQ61409 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pde3bQ61409 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pde3bQ61409 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pde3bQ61409 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pde3bQ61409 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pde3bQ61409 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pde3bQ61409 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pde3bQ61409 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pde3bQ61409 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pde3bQ61409 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pde3bQ61409 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms