Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PcolceQ61398 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms