Protein–RNA interactions for Protein: Q61286

Tcf12, Transcription factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf12Q61286 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tcf12Q61286 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tcf12Q61286 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms