Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc1Q61056 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms