Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
JrkQ60976 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
JrkQ60976 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
JrkQ60976 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
JrkQ60976 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
JrkQ60976 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
JrkQ60976 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
JrkQ60976 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
JrkQ60976 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
JrkQ60976 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
JrkQ60976 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
JrkQ60976 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
JrkQ60976 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms