Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbbp4Q60972 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms