Protein–RNA interactions for Protein: Q60855

Ripk1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk1Q60855 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripk1Q60855 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ripk1Q60855 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ripk1Q60855 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ripk1Q60855 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ripk1Q60855 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms