Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfrsf8Q60846 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms