Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn2dQ60773 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn2dQ60773 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms