Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Stxbp3Q60770 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Stxbp3Q60770 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Stxbp3Q60770 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Stxbp3Q60770 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Stxbp3Q60770 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Stxbp3Q60770 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stxbp3Q60770 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stxbp3Q60770 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stxbp3Q60770 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stxbp3Q60770 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stxbp3Q60770 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stxbp3Q60770 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stxbp3Q60770 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Stxbp3Q60770 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stxbp3Q60770 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stxbp3Q60770 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stxbp3Q60770 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stxbp3Q60770 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stxbp3Q60770 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stxbp3Q60770 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stxbp3Q60770 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stxbp3Q60770 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stxbp3Q60770 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stxbp3Q60770 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stxbp3Q60770 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stxbp3Q60770 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stxbp3Q60770 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms