Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Samhd1Q60710 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Samhd1Q60710 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms