Protein–RNA interactions for Protein: Q60696

Pmel, Melanocyte protein PMEL, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmelQ60696 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmelQ60696 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PmelQ60696 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmelQ60696 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmelQ60696 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmelQ60696 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmelQ60696 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmelQ60696 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmelQ60696 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmelQ60696 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmelQ60696 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms