Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ItgaeQ60677 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms