Protein–RNA interactions for Protein: Q60611

Satb1, DNA-binding protein SATB1, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Satb1Q60611 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Satb1Q60611 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms