Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc1Q60596 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms