Protein–RNA interactions for Protein: Q5U901

Cpa6, Carboxypeptidase A6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa6Q5U901 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpa6Q5U901 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpa6Q5U901 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpa6Q5U901 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpa6Q5U901 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpa6Q5U901 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpa6Q5U901 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpa6Q5U901 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpa6Q5U901 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpa6Q5U901 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpa6Q5U901 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpa6Q5U901 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpa6Q5U901 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpa6Q5U901 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpa6Q5U901 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpa6Q5U901 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpa6Q5U901 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpa6Q5U901 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpa6Q5U901 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpa6Q5U901 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpa6Q5U901 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpa6Q5U901 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpa6Q5U901 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpa6Q5U901 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpa6Q5U901 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpa6Q5U901 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cpa6Q5U901 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cpa6Q5U901 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cpa6Q5U901 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpa6Q5U901 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms