Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Scaf1Q5U4C3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scaf1Q5U4C3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms