Protein–RNA interactions for Protein: Q5U458

Dnajc11, DnaJ homolog subfamily C member 11, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc11Q5U458 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Dnajc11Q5U458 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnajc11Q5U458 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnajc11Q5U458 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnajc11Q5U458 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnajc11Q5U458 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnajc11Q5U458 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnajc11Q5U458 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnajc11Q5U458 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnajc11Q5U458 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnajc11Q5U458 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnajc11Q5U458 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dnajc11Q5U458 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms