Protein–RNA interactions for Protein: Q5U406

Zfp78, Zinc finger protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp78Q5U406 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp78Q5U406 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms